Она была построена в 1864 году в городе Данидин силами немногочисленной местной еврейской общины, образовавшейся там во времена золотой лихорадки. Постепенно число евреев в городе выросло, и в 1880 году была возведена более вместительная синагога на 600 мест, а старая вскоре была продана масонам. Они организовали в здании масонскую ложу, которая просуществовала там вплоть до 1992 года. Масоны добавили к внешнему виду синагоги витраж со звездами Давида, а внутреннее убранство, включая святилище, оставили нетронутым. В начале XX века золото закончилось, и рост еврейской общины остановился.
С тех пор как масоны покинули здание, в синагоге разместились реформистская еврейская община и небольшая картинная галерея. Во дворе синагоги имеется также еврейское кладбище, возникшее во времена ее постройки.
Прием заявок на покупку завершается 7 ноября. Неизвестно, какое будущее ждет самую южную в мире синагогу. Вряд ли ее снесут, поскольку для города это значимый архитектурный объект. Впрочем, новую синагогу Данидина, упомянутую выше, в 1965 году продали организации YMCA и вскоре перестроили в административное здание, а сейчас на том месте находится многоуровневая парковка.