Детская программа фонда «Джойнт» включает самые разные способы поддержки детей в зависимости от их потребностей. Фонд спасал сирот времен Гражданской и Великой Отечественной войны, а в мирные годы был сосредоточен на поддержке семей новых репатриантов, детей с особыми потребностями, детей из неблагополучных и бедных семей.